Logitech MX Keys ve MX Keys S arasındaki bazı farklar şunlardır: USB alıcı: MX Keys, birleştirici (unifying) alıcı kullanırken, MX Keys S, Logi Bolt alıcı kullanır. F1-F12 tuşlarının işlevi: MX Keys'te ilk iki tuş parlaklık ayarlayıcıdır ve F3'ten itibaren pencere ve uygulama kısayolları olarak kullanılır. Tuş yüksekliği: MX Keys S'in tuş kapakları, orijinal MX Keys'e göre yaklaşık bir milimetre daha yüksektir. Yazma deneyimi: Orijinal MX Keys, daha yumuşak bir yazma hissine sahiptir. Yazılım özellikleri: MX Keys S, ek olarak arka ışık seçenekleri için bir sekme sunar. Ayrıca, MX Keys S, orijinal MX Keys'e göre daha pahalıdır.