iPhone S serisi pil ömrü, 500 tam şarj döngüsüne kadar sağlığını korur. Ancak pil ömrü, kullanım şekline bağlı olarak değişebilir: Yoğun kullanım, sık sık tam şarj ve tam boşaltma gibi alışkanlıklar pil ömrünü kısaltabilir. Aşırı ısınma ve yanlış şarj alışkanlıkları da pilin ömrünü olumsuz etkileyebilir. Apple, pilin orijinal kapasitesinin %80'in altına düşmesi durumunda değiştirilmesini tavsiye etmektedir.