MP3 formatında hangi ses formatının daha iyi olduğu, kullanım amacına bağlıdır. MP3 için bazı popüler ses formatları ve özellikleri: WAV (Waveform Audio File Format). AAC (Advanced Audio Coding). FLAC (Free Lossless Audio Codec). OGG (Ogg Vorbis). WMA (Windows Media Audio). Özetle: Yüksek kalite ve orijinal ses dalgalarını koruma için WAV, FLAC, AIFF gibi kayıpsız veya sıkıştırılmamış formatlar tercih edilmelidir. Depolama alanı endişesi varsa, MP3 gibi kayıplı formatlar daha uygundur çünkü daha küçük dosya boyutları sunar.