Sanal klavyeler, fiziksel tuşlar kullanılmadığı için anahtar kaydedici (keylogger) yazılımlarının şifreleri ve kişisel bilgileri ele geçirmesini önleyebilir. Bazı güvenlik riskleri: Ekran görüntüsü alma: Hackerlar, farenin imlecinin sanal klavyedeki butonlara geldiği her anı kaydedebilir. Site güvenliği: Sanal klavye ile girilen bilgiler, site hacklenirse doğrudan kötü niyetli kişilere ulaşabilir. Uyumluluk: Sanal klavyeler, yalnızca Microsoft Internet Explorer, Google Chrome ve Mozilla Firefox tarayıcılarında veri interception'ına karşı koruma sağlar. İnternet bankacılığı gibi işlemlerde, bankanın sunduğu sanal klavye veya güvenlik yazılımlarının sunduğu sanal klavyeler kullanılması önerilir.