Fancoil termostatı, ortamın sıcaklığını ayarlanan değerde tutmak için motorlu vanalar ve fan üzerinden su akışını kontrol ederek çalışır. Çalışma prensibi: Isıtma modu: Ortam sıcaklığı ayarlanan değerin 0,5 derece üzerine çıktığında termostat fancoil ünitesinin çalışmasını durdurur, 0,5 derece altına düştüğünde ise üniteyi çalıştırır. Soğutma modu: Ortam sıcaklığı ayarlanan değerin 0,5 derece üzerine çıktığında termostat fancoil ünitesini çalıştırır, 0,5 derece altına düştüğünde ise ünitenin çalışmasını durdurur. Bazı termostatlar, fan hızını ortam sıcaklığı ile ayarlanan sıcaklık arasındaki farka göre otomatik olarak ayarlayabilir.