Asus M5A99X EVO R2.0 anakartının bazı pin sayıları: USB 3.0 portları: 2 adet 19-pin mavi USB 3.0 bağlantısı ve 3 adet USB 2.0 bağlantısı. SATA portları: 6 adet SATA 6Gb/s ve 2 adet SATA 3Gb/s bağlantısı. Güç bağlantıları: 24-pin EATX ve 8-pin ATX 12V güç bağlantısı. Fan bağlantıları: 1 adet 4-pin CPU Fan, 3 adet 4-pin Chassis Fan ve 1 adet 3-pin Power Fan bağlantısı. Diğer bağlantılar: 1 adet S/PDIF çıkış başlığı, 1 adet COM port bağlantısı.