Pierre van Hooijdonk'un Fenerbahçe'deki lakabı "Aziz Pierre" olarak bilinmektedir. Ayrıca, 2004 yılında Fenerbahçe'nin Sakaryaspor ile oynadığı bir maçta attığı gol sonrası, Türkçe'de "süper denizaltı" anlamına gelen "supersub" lakabı da kendisine taraftarlar tarafından takılmıştır.