Samsunspor'un lig geçmişi şu şekildedir: - 1965-66 sezonu: Samsunspor, 2. Futbol Ligi'nde (günümüzdeki TFF 1. Lig) profesyonel liglere ilk kez adım attı ve sezonu 5. sırada tamamladı. - 1968-69 sezonu: Kulüp, 2. Lig'de ikinci olarak büyük bir başarı elde etti. - 1969: Samsunspor, 1. Lig'e (Süper Lig) yükseldi. - 1974-75 sezonu: Ligin son sırasında yer alarak 2. Futbol Ligi'ne düştü. - 1975-76 sezonu: Beyaz Grup lideri olarak tekrar 1. Lig'e çıktı ve Gençlik ve Spor Bakanlığı Kupası'nı kazandı. - 1984-85 sezonu: Samsunspor, C Grubu'nu lider tamamlayarak tekrar 1. Lig'de yer almaya hak kazandı. - 1985-86 sezonu: Tanju Çolak'ın 33 golüyle gol kralı olduğu sezon, kulüp ligi 3. sırada tamamladı. - 1989: Malatyaspor deplasmanına giderken yaşanan otobüs kazasında teknik direktör ve futbolcular hayatını kaybetti, kulüp büyük bir yas dönemi yaşadı. - 1993: Samsunspor, 13 sezon boyunca kesintisiz olarak Süper Lig'de yer aldı. - 2005-06 sezonu: Ligin 17. sırasında yer alarak Süper Lig'den düştü. - 2011-12 sezonu: Süper Lig'de mücadele eden kulüp, 36 puan toplayarak ligi 16. sırada bitirdi ve tekrar 1. Lig'e düştü. - 2017-18 sezonu: Kulüp, tarihinde ilk kez TFF 2. Lig'e (3. kademe) düştü.