Ruud Boffin, Eskişehirspor'dan iki farklı nedenle ayrıldı: 1. Kadro Dışı Kalma ve Af: 18 Nisan 2016'da, kulüpten alacaklarını tahsil etmek için Türkiye Futbol Federasyonuna başvurduğu gerekçesiyle teknik direktör Samet Aybaba tarafından süresiz kadro dışı bırakıldı. 2. Sözleşmesini Feshetme: 2017 yılında, alacaklarına karşılık sözleşmesini tek taraflı olarak feshetti ve takımdan ayrıldı.