Manisa Spor'un logosunun değişmesinin nedeni, kulübün isim ve kimlik değişikliğine gitmesidir. Manisa Büyükşehir Belediyespor, 31 Temmuz 2019 tarihinde yapılan başvurunun onaylanmasının ardından Manisa Futbol Kulübü adını almış, siyah-beyaz-yeşil olan renkleri siyah-beyaz ve yeşil olarak değiştirilmiş ve yeni bir logo tasarlanmıştır. Ayrıca, 2024 yılında Manisa Basket olarak isim değiştiren kulüp, logosunu ve renklerini tekrar yenileyerek siyah-beyaz-kırmızı olarak belirlemiştir.