Yeni Malatyaspor'un küme düşmesinin başlıca nedenleri şunlardır: 1. Maddi ve Yönetimsel Sorunlar: Kulüp, pandemi süreci ve transfer yasağıyla birlikte maddi krizler yaşadı. 2. Deprem Etkileri: 2023'teki depremler sonrası ligden çekilme kararı aldı ve çoğu futbolcusuyla yollarını ayırdı. 3. Puan Silme Cezaları: Türkiye Futbol Federasyonu tarafından verilen 3 puan silme cezası ve FIFA'nın kulübe 18 puan silme cezası, takımın puan durumunu olumsuz etkiledi. 4. Son Maç Sonuçları: Ligde oynadığı son maçlarda aldığı ağır yenilgiler, matematiksel olarak küme düşmesini kesinleştirdi.