Karabük İdman Yurdu, tarihinde bir kez küme düşmüştür. Kulüp, 2024-2025 sezonunda TFF 3. Lig 3. Grup'ta mücadele ederken, maddi imkansızlıklar nedeniyle ikinci yarı maçlarına çıkmama kararı almış ve ligden çekilmiştir . Bu nedenle, Karabük İdman Yurdu'nun resmi olarak küme düşme sayısı birdir.