Kaan Ayhan, kalbinin daha çok Türkiye için çarptığını belirterek, gelecekte Türk Milli Takımı'nda oynamaya karar verdiğini ifade etmiştir. Daha önce Almanya Milli Takımı'nın alt yapı takımlarında forma giyen Ayhan, 2013 yılında Türkiye 21 yaş altı milli futbol takımı kadrosuna dahil edilmiştir.