Fenerbahçe'nin 2024-2025 sezonunda Türkiye Kupası'na katılıp katılmayacağı belirsizdir. Türkiye Futbol Federasyonu (TFF) Başkan Vekili Mecnun Otyakmaz, Fenerbahçe'nin durumuyla ilgili olarak, "Henüz elimize ulaşan bir yönetim kurulu kararı olmadığı için rutinimizi bozmadan kura çekimine devam ediyoruz" ifadelerini kullanmıştır. Ancak, Fenerbahçe Kulübü 29 Kasım 2024 tarihinde TFF'ye bir yazı göndererek 2024-2025 sezonunda Türkiye Kupası'na katılım sağlamayacağını bildirmiştir.