Fenerbahçe Espor takımının mücadele ettiği lig, oynadıkları espor oyununa göre değişiklik göstermektedir: League of Legends: Fenerbahçe Espor, Türkiye Şampiyonluk Ligi'nde (TCL) yer almaktadır. NBA2K: Fenerbahçe NBA2K takımı, Bounce League'de mücadele etmektedir. PUBG Mobile: Fenerbahçe PUBG Mobile takımı, Türkiye Espor Futbol Ligi (TEFL) Süper Kupası'nda yer almaktadır. VALORANT: Fenerbahçe VALORANT takımı, VALORANT Challengers 2025 Türkiye: Birlik liginde mücadele etmektedir.