Fenerbahçe Spor Kulübü Müzesi'nde sergilenen bazı kupalar şunlardır: Futbol: Süper Lig (19 kupa), Türkiye Kupası (7), Süper Kupa (3), Cumhurbaşkanlığı Kupası (6), Başbakanlık Kupası (8), General Harington Kupası, Millî Küme (6), Türkiye Futbol Şampiyonası (3). Basketbol: EuroLeague (1), Türkiye Basketbol Ligi (11), Türkiye Kupası (7). Voleybol: Sultanlar Ligi (6), CEV Challenge Kupası, Balkan Kupası (2). Ayrıca, müzede 100 yılda farklı branşlarda kazanılan 3000 kupa, şilt ve plaketten 426 tanesi de sergilenmektedir.