Fenerbahçe'nin 28 şampiyonluk olarak sayılmasının sebebi, Türkiye Futbol Federasyonu (TFF) tarafından düzenlenen ulusal şampiyonlukları kapsamasıdır. Fenerbahçe, Türkiye Futbol Birinciliği’ni 3 kez, Milli Küme’yi 6 kez ve Süper Lig’i ise 19 kez kazanmıştır. Ancak, Fenerbahçe 1959 öncesi şampiyonlukların da hesaba katılması için Türkiye Futbol Federasyonu'na (TFF) başvuru yapmış, ancak bu başvuru henüz yanıtlanmamıştır. UEFA ise, 2022 yılında resmi bir yayında 1924-1959 arası dönemde Türkiye'de oynanan ulusal şampiyonları kabul ettiğini açıklamıştır.