Aykut Kocaman'ın Fenerbahçe'den kovulma nedeni olarak çeşitli iddialar bulunmaktadır. Transfer anlaşmazlığı. Başkan Aziz Yıldırım ile fikir ayrılığı. Aykut Kocaman, istifasının kabul edildiği gün yaptığı açıklamada, kesinlikle bir kovulma veya önceden verilmiş bir kararın söz konusu olmadığını, bu kararın kendisi ve kulüp için en doğrusu olduğunu ifade etmiştir.