Beşiktaş'tan çeşitli noktalara vapur seferleri düzenlenmektedir. Başlıca güzergahlar şunlardır: Kadıköy: Şehir Hatları tarafından düzenlenen seferlerle Beşiktaş'tan Kadıköy'e ulaşım sağlanabilir. Üsküdar: Beşiktaş İskelesi'nden Üsküdar'a da vapur seferleri mevcuttur. Eyüpsultan: Beşiktaş-Eyüpsultan hattı, Kabataş, Karaköy, Kasımpaşa, Hasköy, Sütlüce gibi duraklardan geçer. Adalar: Beşiktaş'tan Büyükada ve Heybeliada gibi adalara da vapur seferleri bulunmaktadır. Eminönü: Beşiktaş-Eminönü hattı, Karaköy üzerinden devam eder. Ayrıca, Beşiktaş İskelesi'nden Sarıyer, Beykoz ve Rumeli Kavağı gibi diğer noktalara da vapur seferleri mevcuttur. Güncel sefer saatleri ve detayları için Şehir Hatları'nın resmi web sitesi ziyaret edilebilir.