Seyhan Barajı'nın suyu, Seyhan Nehri'nden gelmektedir. Seyhan Nehri'ni oluşturan iki büyük kol vardır: Kayseri’nin Pınarbaşı’nın 1650 metre yüksekliğindeki Uzunyayla’dan doğan Zamantı suyu; Orta Torosları geçerek, Çukurova’ya inmeden önce Adana’nın 80 km kuzeyinde, diğer önemli kolu olan Göksu. Seyhan Nehri, Adana-Mersin sınırında Tarsus Çayı ile birleşerek Akdeniz’e dökülür.