İstanbul Havalimanı'nda kullanılan bazı kontuar ve alanlar şunlardır: İç hat check-in kontuarları: 1 ve 2 numaralı kapılardan girildiğinde D koyunda yer alır. Dış hat check-in kontuarları: 3 ve 4 numaralı kapılardan girildiğinde F, G, H ve J koylarında yer alır. Özel check-in kontuarları: G koridoru büyük seyahat grupları ve özel ihtiyaçları olan kişiler, K koridoru ise aileler için ayrılmıştır. ABD, İngiltere ve Kanada uçuşları: K kontuarından check-in yapılır. Business class ve Miles & More üyeleri: 5 numaralı kapıdan giriş yapabilir. Ayrıca, İstanbul Havalimanı'nda 566 check-in kontuarı bulunmaktadır; 36 adet bag-drop (insansız bagaj teslimi) kontuarı ve 112 self check-in kiosku hizmet vermektedir.