İstanbul'daki kayıp adaların, özellikle Vordonisi Adası'nın batmasının nedeni, 1010 yılında yaşanan büyük İstanbul depremi olarak kabul edilmektedir. Yapılan bilimsel araştırmalara göre, Vordonisi Adası'nın alüvyon ve gevşek bir tabakadan oluşması, diğer adaların ise granit kayalıklar üzerinde yer alması, adanın batmasına yol açan faktörler arasında gösterilmektedir. Deprem dışında, zamanla deniz sularının yükselmesi ve adanın deprem hareketliliği nedeniyle giderek daha fazla sulara gömüldüğü de belirtilmektedir.