Bernina Ekspresi, İsviçre'nin Chur kasabasından İtalya'nın Tirano kasabasına kadar olan ana rota üzerinde yaklaşık 4 saat sürmektedir. Ancak, farklı rotalar ve dönemler için süreler değişebilir: Mayıs - Ekim ayları arasında: Davos veya St. Moritz'den başlayan rotalar. 21 Şubat - 21 Nisan ve 21 Nisan - 31 Ekim tarihleri arasında: Tirano'da inilen trenden Bernina otobüsüyle Lugano'ya devam edilebilir, bu yolculuk yaklaşık 3 saat sürer. Yolculuk süresi, yoğun sezon ve inşaat çalışmaları gibi durumlara bağlı olarak değişebilir.