Şilomikron ve VLDL (Çok Düşük Yoğunluklu Lipoprotein) arasındaki temel farklar şunlardır: 1. Sentez Yeri: Şilomikronlar, ince bağırsakta enterositler tarafından sentezlenirken, VLDL karaciğerde üretilir. 2. Taşınan Maddeler: Şilomikronlar, beslenmeyle alınan trigliseritleri taşırken, VLDL karaciğerde sentezlenen trigliseritleri taşır. 3. Yoğunluk ve Boyut: Şilomikronların yoğunluğu <0.930 g/ml ve çapı 75-1200 nm iken, VLDL'nin yoğunluğu 0.930-1.006 g/ml ve çapı 30-80 nm'dir. 4. Apoproteinler: Şilomikronlarda başlıca apoproteinler Apo B-48, Apo C, Apo E iken, VLDL'de Apo B-100, Apo E ve Apo C'dir.