Ronaldo Nazario'nun sakatlanmalarının başlıca nedenleri arasında diz kapağı ile uyluk kemiği arasındaki dengesizlik ve aşırı patlayıcı gücü bulunmaktadır. 1999 yılında Inter Milan'ın Lecce karşısındaki maçında ciddi bir sakatlık yaşadı. 2000 yılında, Inter ile Lazio arasındaki Coppa Italia finalinde, diz kapağındaki tendonların tamamen yırtılması sonucu ağır bir sakatlık geçirdi. Bu sakatlıklar, Ronaldo'nun futbol kariyerini uzun süre etkilemiş ve birçok kez sahalardan uzak kalmasına neden olmuştur.