Burun spreyleri, bazı durumlarda alerjiye neden olabilir. Özellikle kortizon içeren burun spreyleri uzun süre kullanıldığında burun mukozasını tahriş edebilir ve alerjik reaksiyonlara yol açabilir. Ayrıca, dekonjestan spreylerin aşırı kullanımı da "rebound etkisi" olarak adlandırılan burun tıkanıklığını artırabilir ve bu da alerjik semptomları kötüleştirebilir. Burun spreyi kullanmadan önce bir doktora danışmak ve doktorun önerdiği şekilde kullanmak önemlidir.