GİS (gastrointestinal sistem) hastanesinde bulunan bazı bölümler şunlardır: Genel Cerrahi: Mide, yemek borusu, kalın bağırsaklar, ince bağırsaklar, karaciğer, anal kanal, anüs, safra yolları ve pankreasın ameliyat ile tedavisi yapılan hastalıklarının tümünü kapsar. Gastroenteroloji: Gastrointestinal sistemle ilgili hastalıkların teşhis ve tedavisiyle ilgilenir. Göğüs Cerrahisi: Boğaz ile başlayıp karın bölgesinin üst bölümüne kadar olan, meme ile kalp hariç diğer organların hastalık teşhis ve tedavisini yapar. Ayrıca, hastanelerde genellikle dahiliye, göz sağlığı ve hastalıkları, geriatri, genetik hastalıklar ve tanı merkezi gibi bölümler de bulunur.