Askeri okullarda bazı hastalıklar nedeniyle eleme yapılabilir. Bu hastalıklar arasında: Göz hastalıkları: -3 diyoptriyi aşan hipermetropi, miyopi ve eksenler arasındaki farkı 1 diyoptriyi aşan astigmatizmalar. Astım hastalığı. Renk körlüğü (diskromatopsi). Kronik ve sık nüks eden sinüzit, kronik tonsilit, atrofik rinit ve nefes almaya engel olan üst solunum yolu hastalıkları. Her iki kulağın işitme kuvvetinin birbirine yakın olmaması. Psikiyatrik hastalıklar. Ayrıca, hepatit B, hepatit C, HIV, yaygın sekelle iyileşmiş veya aktif tüberküloz gibi hastalıklar da askeri okula girişe engeldir. Eleme kriterleri, Türk Silahlı Kuvvetleri, Jandarma Genel Komutanlığı ve Sahil Güvenlik Komutanlığı Sağlık Yeteneği Yönetmeliği'nde detaylı olarak belirtilmiştir.