Mizofoninin nedenleri tam olarak bilinmemektedir, ancak genetik yatkınlık, çevresel faktörler ve beyin işlevlerindeki farklılıkların etkili olduğu düşünülmektedir. Mizofoniyi tetikleyebilecek bazı durumlar: Çocukluk döneminde yaşanan travmatik deneyimler. Psikolojik bozukluklar, özellikle anksiyete bozukluğu, depresyon, obsesif-kompulsif kişilik bozukluğu ve Tourette sendromu. Beyin yapısındaki ve işlevindeki farklılıklar, özellikle işitsel korteks ve duygusal düzenleme ile ilgili bölgelerde anormal aktivite. Uzun süre yüksek sese maruz kalma, beyin travması, bağırsak ve yeme bozuklukları gibi durumlar. Mizofoninin kesin nedeni ve nasıl oluştuğuna dair bilgiler hala araştırma aşamasındadır.