The Beast Inside, iki farklı zaman diliminde geçen bir hikâye sunar: Günümüz: CIA kripto çözümleme uzmanı Adam Stevenson, hamile karısıyla birlikte ailesinin ücra ormanlık kulübesine taşınır. 19. yüzyıl: 19. yüzyılda sözde ortak evde yaşamış olan Nicolas Hyde'ın yazıp çizdiği gizemli bir günlük bulunur. Oyun, Adam ve Nicolas'ın kaderlerinin nasıl çarpıştığını ve bu hikâyenin nasıl sona ereceğini oyuncunun belirlemesine olanak tanır. Ayrıca, oyun boyunca Nicolas'ın annesinden hiç bahsedilmemesi ve bazı mantık hataları, oyuncular tarafından eleştirilmiştir.