Subnautica'yı çevrimiçi oynamak için iki yöntem bulunmaktadır: 1. Subnautica: Below Zero Sürümü: Sadece bu sürüm, çevrimiçi çok oyunculu modu desteklemektedir. 2. Nitrox Modu: Bu, PC oyuncuları için geliştirilmiş bir açık kaynaklı çok oyunculu moddur.