Sonic Frontiers oyunu, Doktor Eggman'in mistik güçler tarafından yaratılan bir teknolojiyi çalmak üzere Starfall Adaları'na gitmesiyle başlar 4. Sonic, Tails ve Amy, Eggman’ı adalara çeken teknolojinin ne olduğunu araştırmaya karar verir 24. Yolculukta uçakları Siber Uzay portalına çok yaklaştığı için portalın çekimine karşı koyamazlar ve Sonic gerçek ve dijital dünya arasında sıkışıp kalır 24.

Bir ses, Sonic'e bu boşluktan çıkıp gerçek dünyaya dönebilmek için Chaos Emeralds’ı bulup adadaki robotları yok etmesi gerektiğini söyler 24. Sonic, arkadaşlarıyla birlikte üç arkadaşını Siber Uzay'dan kurtarır ve The End'in Dünya'yı yok etmeyi planladığını öğrenir 24.

Sonic ve ekibi, The End ile mücadele eder ve The Supreme’i kurtarmayı başarır 4. Sage, The End’e son darbeyi vurabilmek için kendini feda eder 4. Eggman, Sage'i canlandırmak için adanın teknolojisini kullanırken, Sonic'in arkadaşları iyileşir ve onlarla birlikte adaları terk eder 4.