Sonic Frontiers hikayesi, Sonic ve arkadaşlarının Starfall Adaları'nda Chaos Emeralds'ı toplama ve dünyayı tehdit eden robotik Titanlar'ı yenme çabalarını anlatır 25.

Oyunun başında Dr. Eggman, "Ancients" bilgisinden yararlanarak bir dizi robot çağırır ve bu robotlar onu Cyber Space adlı dijital bir boyuta hapseder 1. Orada, Dr. Eggman'e yardım eden Sage, Sonic'i ve arkadaşlarını bulup onları serbest bırakmaya çalışır 1.

Sonic, arkadaşlarını kurtarırken kendi bedeninin bir kısmını onlara verir ve bu süreçte siber korozyona uğrar 1. Sonunda, çok fazla yozlaştığı için boyutlar arasında sıkışıp kalır 1. Arkadaşları, güçlerini ona geri vererek onu gerçek dünyaya geri getirirler 1.

Sonic ve Eggman daha sonra son Titan'ı, dünyalar arasındaki engelleri ortadan kaldırmaya ve kontrolü ele geçirmeye çalışan güçlü bir güçle savaşmak için bir araya gelirler 1. Sonunda, Sage'in yardımıyla bu düşmanı yenerler ve Sonic'in arkadaşlarını dünyaya geri getirirler 1. Sage ise kendini feda ederek Dr. Eggman'i kurtarır 1.