Scooby-Doo oyunları genellikle ipuçları toplama, olayı çözme ve gerçeği açığa çıkarma temalarını işler. Örneğin, "Scooby-Doo! Who's Watching Who?" oyununda, Mystery Inc. ekibi, GSI: Ghost Scene Investigators ekibinin yıldızlarıyla yarışmaya davet edilir. "Scooby-Doo 2: Monsters Unleashed" ise, Scooby ve arkadaşlarının Coolsville Kriminoloji Müzesi'nin büyük açılışında, Pterodaktil Hayaleti'nin kaçması ve onlardan intikam almakla tehdit etmesi etrafında döner.