Nintendo 64 (N64) modelinin birçok farklı modeli ve renk çeşidi bulunmaktadır. İşte bazı modeller: Nintendo 64 Standard Charcoal: Orijinal sürüm, gri kontrolcü ile birlikte gelir. Nintendo 64 Funtastic: Jungle Green, Ice Blue, Grape Purple, Fire Orange, Smoke Black ve Watermelon Red gibi renk seçenekleri içeren bir seri. Nintendo 64 IQue: Çin'de piyasaya sürülen, farklı bir tasarıma sahip model. Nintendo 64 Lawson Station: Japonya'da Lawson mağazaları ile işbirliği içinde piyasaya sürülen, nadir bir model. Nintendo 64 ANA: Japonya'da All Nippon Airways (ANA) ile promosyon olarak sunulan model. Nintendo 64 Buck Bumble: Almanya'da bir dergi kampanyası ile verilen model. Nintendo 64 Daiei Hawks: Japonya'da özel bir sürüm. Nintendo 64 Pikachu: Pokémon temalı, Japonya'da piyasaya sürülen modeller. Bu modellerin yanı sıra, N64'ün farklı bölgelerde ve paketlerle sunulan çeşitli sürümleri de bulunmaktadır.