Mortal Kombat, kurgusal bir evrende geçen ve ölümlü savaşçıların katıldığı bir turnuvayı konu alır. Hikayenin temelinde, Elder Gods olarak bilinen varlıkların yarattığı on sekiz alem arasında geçen savaşlar yer alır. Turnuva, bir alemin başka bir alemi ele geçirmek istemesi durumunda üst üste on kez kazanması gereken bir mücadeledir. Serinin bazı önemli olayları: Mortal Kombat I: Earthrealm savaşçıları, Outworld'ü yenerek Liu Kang'in şampiyon olmasını sağlar. Mortal Kombat II: Shao Kahn, Earthrealm savaşçılarını Outworld'e çeker ve Shao Kahn, Blaze'i yenerek galip gelir. Mortal Kombat X: 25 yıl sonra, Shinnok'un serbest kalmasıyla barış anlaşması tehlikeye girer. Hikaye, dövüşlerin yanı sıra, karakterlerin mitolojik referanslarla dolu diyaloglarını da içerir.