Mortal Kombat 2: Annihilation filmi, dünyayı ele geçirmeye çalışan kötü bir savaş lorduyla mücadele eden bir grup kahramanın hikayesini anlatıyor. Filmde, Raiden, Earthrealm savaşçılarını toplayıp onları Outworld'e götürerek Shao Kahn'ın düzenlediği Mortal Kombat turnuvasının rövanşına katılıyor.