Mortal Kombat 1, Liu Kang'in evreni yeniden yaratmasını ve Outworld ile kurduğu ittifakı konu alır 34.

Hikaye, Liu Kang'in Kronika ve Shang Tsung'u yenmesinin ardından, evrenin kontrolünü Geras'a bırakarak Dünya'nın koruyucusu olmasıyla başlar 34. Liu Kang, Earthrealm'in koruyucusu olarak Outworld ile zayıf bir ittifak kurar ve iki diyar arasında bir turnuva düzenler 34.

Liu Kang, son turnuvada yarışmak üzere Kung Lao, Raiden, Johnny Cage ve Kenshi gibi dövüşçüleri bir araya getirir 23. Turnuvayı Raiden kazanır 3. Ancak, Shang Tsung'un faaliyetleri ve Outworld'ün yeni lideri Sindel'in danışmanlığını yapması, Liu Kang'i endişelendirir 3.

Liu Kang, Kenshi, Kung Lao ve Johnny Cage'i Shang Tsung'u araştırmak üzere görevlendirir 3. Bu süreçte, Shang Tsung'un Tarkatan lideri Baraka ile işbirliği yaptığını ve Outworld'ü tehdit ettiğini keşfederler 3.

Hikaye, Liu Kang'in şampiyonlarını bir akşam yemeğinde kutlaması ve ardından Scorpion ile Smoke'a Earthrealm'i gelecekteki çatışmalara karşı hazırlamalarına yardım etmesiyle sona erer 3.

Oyunun sonunda, alternatif bir zaman çizgisinden gelen savaşçılar, Liu Kang ve Shang Tsung'un savaşını gözlemler 3.

Hikaye, serinin önceki oyunlarından farklı olarak daha sakin bir tempoya sahiptir 5. Kadercilik ve özgür irade temaları yerine, karakterler arasındaki karmaşık ilişkiler ve gizli güçler ön plana çıkar 5.