Minecraft'ta biyom karışımı, bazı biyomların sınırlarında geçiş bölgeleri veya yeni biyomlar oluşturulmasıdır. Örneğin: Savan ve çöl sınırı: Çöl, karlı tundra ile sınırlıysa, ormanlık dağlar biyomu oluşabilir. Bataklık ve yağmur ormanı sınırı: Bataklık, yağmur ormanıyla sınırlıysa, yağmur ormanı sınırı biyomu oluşur. Bataklık ve çöl veya karlı tundra çevresi: Bataklık, çöl veya karlı tundra ile çevriliyse, düzlükler biyomu oluşur. Ayrıca, bazı biyomların "değiştirilmiş" veya "tepe" varyantları da vardır.