Minecraft'ta çeşitli nesneleri boyamak için 16 farklı renk boyası kullanılabilir. Doğal boyalar: Beyaz: Kemik tozu, inci çiçeği, yol kalıntısı (garip çakıl). Siyah: Mürekkep kesesi, wither gülü. Kahverengi: Kakao çekirdekleri. Kırmızı: Gül çalısı, kırmızı lale, gelincik. Sarı: Ayçiçeği, karahindiba. Pembe: Şakayık, pembe lale. Mavi: Lapis lazuli, peygamber çiçeği. Yeşil: Deniz salatası, kaktüs. Karışık boyalar: Gri: Beyaz + siyah. Turuncu: Sarı + kırmızı. Açık mavi: Mavi + beyaz. Mor: Mavi + kırmızı. Ayrıca, gezgin tüccardan zümrüt karşılığında çeşitli boyalı kumaşlar da alınabilir.