Lego Ninjago'nun 2. sezonunda toplam 13 bölüm bulunmaktadır: 1. "Darkness Shall Rise" (Karanlık Yükseliyor); 2. "Pirates vs. Ninja" (Korsanlar vs. Ninjalar); 3. "Double Trouble" (Çifte Bela); 4. "Ninjaball Run" (Ninjatopu Koşusu); 5. "Child's Play" (Çocuk Oyuncağı); 6. "Wrong Place, Wrong Time" (Yanlış Yerde, Yanlış Zamanda); 7. "The Stone Army" (Taş Ordu); 8. "The Day Ninjago Stood Still" (Ninjago'nun Durduğu Gün); 9. "The Last Voyage" (Son Yolculuk); 10. "The Island of Darkness" (Karanlıklar Adası); 11. "The Last Hope" (Son Umut); 12. "The Return of the Overlord" (Derebeyi'nin Dönüşü); 13. "Rise of the Spinjitzu Master" (Spinjitzu Ustası'nın Yükselişi).