LEGO Bionicle, biyomekanik varlıklardan oluşan bir evrende geçen bir hikayeyi anlatır. Temel hikaye, Matoran adlı halkı koruyan ve büyük ruh Mata Nui'yi uyandırmaya çalışan altı Toa kahramanının maceralarını konu alır. Hikayenin arka planında, Matoran'ın yaşadığı adayı ele geçiren Makuta'nın kötü niyetli eylemleri ve adanın doğasını Matoran'a karşı çevirmesi yer alır. Hikaye, kitaplar, çizgi romanlar, oyunlar ve animasyon filmleri gibi çeşitli medya türlerinde anlatılmıştır. Bionicle teması, 2000 yılında başlamış ve 2010 yılında düşük satışlar nedeniyle sona erdirilmiş, ancak 2015 yılında iki yıl daha devam etmek üzere yeniden başlatılmıştır.