Knight Online'ın hikayesi, çeşitli tanrıların kendi aralarındaki güç savaşını konu alır. Bu tanrılar, aynı zamanda oyunda yer alan sunucuların da isimleridir: Pathos, Logos, Carnac, Akara, Cypher ve daha fazlası. Olayların özeti: - Xigenon Tanrısı, kendi ülkesi Karus'u kurarken, uzun süredir sakin bir yaşam süren El Morad, Cypher tarafından kurulur. - Savaşın büyümesi, beraberinde kaosu getirir ve çoğu şehir yıkılır, yakılır, parçalanır. - Herkes, son çareyi El Morad'a kaçmakta bulur. - Ancak savaş bitecek gibi görünse de, aslında her şey yeni başlamaktadır.