Halo'nun ilk sezonu, 26. yüzyılda geçen ve Birleşmiş Milletler Uzay Komutanlığı ile Covenant adı verilen uzaylı bir ittifak arasındaki savaşı konu alıyor. Sezonun ana olayları: - Master Chief Petty Officer John-117 liderliğindeki Spartan-II ekibinin, Madrigal gezegenindeki bir İnsurrectionist karakoluna yapılan Covenant saldırısını durdurması. - John'un, Covenant'ın Prophet of Mercy'ye bildirdiği, dokunduğunda gizemli semboller gösteren bir Forerunner anahtarını keşfetmesi. - Dr. Catherine Halsey ile ONI Amirali Margaret Parangosky arasındaki, Halsey'nin Cortana adlı yapay zeka üzerindeki çalışmaları hakkındaki anlaşmazlık. - John'un, Kwan Ha'yı idam etme emriyle karşı karşıya kalması ve bu durumun onun ve Kai'nin davranışlarını değiştirmesi. - Sezonun sonunda, Halo halkasının koordinatlarını belirlemek için bir cihazın bulunması.