Ghost of Tsushima'da ana hikaye ve destan farklı kavramlardır. Ana hikaye, oyunun temel senaryosunu ve Jin Sakai'nin Moğollara karşı verdiği mücadeleyi anlatır. Destan ise, oyunun seviye sistemini ifade eder. Bu, hikayeden bağımsız olarak karakterin gelişim sürecini yansıtır.