Otobotlar ve Decepticonlar arasındaki temel farklar şunlardır: Köken: Her iki grup da Cybertron'da ortaya çıkmıştır. Amaç: Otobotlar, barışçıl iş birliğine inanan ve iyi olanı temsil eden bir gruptur. Liderler: Otobotların lideri Optimus Prime, Decepticonların lideri ise Megatron'dur. Sembolizm: Otobotların mavi gözleri, Decepticonların ise kırmızı gözleri vardır. Dönüşüm: Otobotlar genellikle araba gibi sivil araçlara dönüşürken, Decepticonlar askeri araçlar (jetler, tanklar, helikopterler) olarak dönüşür. Bu farklılıklar, Transformers evrenindeki iki grubun binlerce yıldır süren çatışmasını açıklar.