Passat B6 ve B5 modelleri arasındaki temel farklar şunlardır: - Tasarım: Passat B6, Golf PQ46 platformunu baz alırken, B5 platformu Audi A4 ile paylaşılmaktaydı. - Motor Seçenekleri: B6 modelinde daha geniş bir motor yelpazesi bulunurken, B5 modelinde 1.8T 150 hp gücünde bir turbo destekli benzinli ünite kullanılmaktaydı. - Donanım: B5.5 olarak anılan 2001 sonrası B5 modelleri, daha modern bir iç mekana ve bazı mekanik iyileştirmelere sahipti. - Üretim Yılı: B6 modeli 2005-2010 yılları arasında üretilirken, B5 modeli 1996-2005 yılları arasında üretilmiştir.