Seat Leon MK2'nin tutulmama nedenleri arasında kronik sorunlar ve kullanıcı deneyimleri öne çıkmaktadır. Kronik sorunlar: Enjektör şıkırdaması. EGR ve devirdaim pompasından kaynaklanan su eksiltme. DPF sorunları. Kullanıcı deneyimleri: Sert süspansiyon sistemi. Yalıtımın zayıf olması. Bilinçsiz modifikasyonların olumsuz etkileri. Ayrıca, eski model olması ve güncel teknolojik özelliklerin eksikliği de Leon MK2'nin tercih edilmemesine neden olabilir.