Matrix serisinin en iyi filmi konusunda kesin bir görüş yoktur, ancak bazı filmler serinin hayranları tarafından öne çıkarılmaktadır: 1. The Animatrix: Matrix evreninde geçen ve serinin öncesindeki olayları anlatan animasyon antolojisi, hayranlar tarafından sıkça önerilir. 2. Inception (Başlangıç): Gerçeklik algılarını sarsan ve Matrix'e benzer bir atmosfere sahip olan bu film, birçok kişi tarafından serinin en iyilerinden biri olarak değerlendirilir. 3. Ghost in the Shell (Kabuktaki Hayalet): Matrix'in yarattığı dünyayı ve atmosferi sevenlerin izlemesi gereken bir diğer film olarak gösterilir. Ayrıca, serinin ilk filmi olan The Matrix de eleştirmenler ve izleyiciler tarafından büyük beğeni toplamış ve birçok ödül kazanmıştır.