Honda logosunun tasarımı birkaç kez değişti: 1961-1969 yılları arasında kullanılan logo, burgundy kırmızı arka plan ve açık mavi "H" harfiyle farklı bir stile sahipti. 1981 yılında logo, siyah "H" ve beyaz zeminle günümüz tasarımına benzer bir hale geldi. 2000 yılında ise logoda bazı ince ayarlar yapıldı; "H" harfinin çizgileri uzatıldı ve logo parlak kırmızı renkle tamamlandı. Dolayısıyla, Honda logosunun temel tasarımı 2000 yılında son halini aldı.