Biyodizel ve biyoyakıt arasındaki temel farklar şunlardır: 1. Kaynak: Biyodizel, bitkisel yağlar (ayçiçeği, soya, kanola vb.), hayvansal yağlar veya atık yemeklik yağlar gibi yenilenebilir kaynaklardan elde edilir. 2. Kimyasal Yapı: Biyodizel, yağ asitleri metil esterleri (FAME) olarak bilinen moleküllerden oluşurken, dizel hidrokarbon adı verilen uzun zincirli moleküllerden oluşur. 3. Çevresel Etki: Biyodizel, yenilenebilir bir kaynak olduğundan ve yaşam döngüsü boyunca daha az sera gazı salınımı yaptığı için daha çevre dostudur. 4. Kullanım: Biyodizel, dizel motorlarda yakıt olarak kullanılabilir ve mevcut dizel motorlarda herhangi bir modifikasyon gerektirmeden kullanılabilir. Biyoyakıtların kullanımı ise daha sınırlı olabilir.